自贡东站建筑主体总建筑面积约3.5万平方米，自贡东站建筑主体为三层，包括地下出站层、站台层和高架候车层。建筑主体整体外观设计寓意“横跨两千年的盐业开采是自贡独一无二的文化结晶”。